Misora, Lecty und Rico vom Sturmtrupp E601 trainieren fleißig unter der Anleitung von Kanata für das anstehende Mystogan-Turnier. Sie wollen kräftig mitmischen und ihr neues Können unter Beweis stellen. Dann finden sie jedoch heraus, dass Freon plant ihr Team aufzulösen. Nur wenn sie das Turnier gewinnen, will sie ihnen noch eine zweite Chance geben. Die Mädchen sind zuerst zwar schockiert, beschließen dann aber bis an ihre Grenzen zu gehen, damit ihr Team bestehen bleibt. Doch die anderen Teams zu schlagen, ist viel leichter gesagt als getan... Basierend auf den gleichnamigen Lightnovels erscheint nun auch der Anime zu SKY WIZARDS ACADEMY. Die Zeit für den Kampf gegen die Monsterkäfer ist gekommen!